事实上，除了邓飞的“免费午餐”挂靠在中国社会福利基金会名下外，目前运作良好的“微公益”都选择了挂靠公募基金会成立专项基金获得合法身份，王克勤发起的“大爱清尘”挂靠在中华社会救助基金会，资深媒体人孙春龙发起的“老兵回家”，则是在民间组织活跃、政府管制相对宽松的深圳市成立专门的基金会……运营成本激增的“危险信号”

　　
　　由于网络是接受捐赠的主要渠道，相比传统公益机构接受的捐助大多为现金或物资，“微公益”接受的捐赠在形式上丰富得多，比如，“免费午餐计划”近期就收到一些现金、实物外的捐赠，有人提出捐出写字楼的使用权，给“免费午餐”做办公室；有人提出捐出酒店几个夜晚的住宿，供“免费午餐”团队开展工作时入住……2011年12月14日，邓飞在微博上表示，设想用其朋友捐赠给“免费午餐”的4辆越野车，进行公车公用的实验，将每次因公离库、回库以及里程、油费进行公示，这引起了一名网友的担忧：这是非常危险的信号，固定资产意味着运营成本的激增。他通过微博先后向邓飞发出两封公开信，对“免费午餐”的运作提出“项目运营成本应单独募捐”“公开票选设立拨款委员会”“明晰组织边界与功能”等建议，并警示“‘免费午餐’项目承担不起名誉上的失败”。他建议，运营成本应该另想办法，可以通过私人朋友或企业专款定额赞助，别与善款混在一起。

　　
　　邓飞对媒体坦言，“免费午餐”发展到现在，不足之处在于是志愿者组织的，没有足够的专职人员和全职人员。“公益做到最后，需要精细化、正规化，这一块确实做得不够好。8个多月的时间、精力，主要都是在找学校、开餐、监督学校，最开始要解决的问题是避免贪污浪费。”

　　
　　如今，越来越多的“微公益”组织者意识到，单纯利用网络，缺乏机构的规范管理，活动将难以持续。人们针对“微公益”的一些质疑，亦与其专业化不足的现状有关。

　　
　　“微公益”的生命力在于公开、透明、自发，政府应该为“微公益”建立规范机制和游戏规则，引导其走上正规化发展的道路。作为新的公益形态，“微公益”组织也应当主动从传统的公益机构中寻找规范的经验与教训，采取透明化、专业化操作。

　　
　　部分“微公益”的发起者也认为，依靠个人单打独斗、募捐、找志愿者这种走一步看一步的操作方法，只能作为民间公益的第一阶段。当慈善项目达到一定规模后，一定要确定一种机制，将公益项目制度化，这样项目才能具有持续性，即使最初的发起者和管理者退出，慈善项目也能继续运作。相对于目前的自发式与分散式，“微公益”更需要一种可持续的模式。